在非法营运案件中，常存在违法行为的实施者(通常为驾驶员)与车辆所有人不一致的情况，需要在全面调查核实基础上认定违法行为当事人，不能简单将车辆所有人认定为当事人。对于具体认定，一般有以下几种情形:一是驾驶员自行实施的，应当以驾驶员为处罚对象，车辆等工具是违法行为的工具，车辆等工具的所有人不影响违法对象的认定。二是驾驶员受车辆等工具所有人指使的行为，应当以车辆等工具所有人为处罚对象。三是还可能存在车辆所有人、道路运输经营人和驾驶人是三个人的情况，这个时候应当以实际经营人为处罚对象。此外，如果驾驶人没有取得相应从业资格证，应当依法另行处罚。
